La seconde saison compte le plus d’épisodes. On prend les mêmes, et on recommence ! Des intrigues toujours aussi inventives, et la mise en avant de nouveaux personnages, comme Craig, le collègue de Lois, Cynthia, l’amie de Malcolm, ou encore l’affreuse grand-mère Ida, ainsi que le développement plus poussé de la personnalité des personnages principaux. On remarquera la fin de saison très réussie avec un épisode de flash-back des naissances des enfants et une grande décision de Francis…
Épisode 1
Expulsés du parc aquatique, la famille se retrouve coincée dans un embouteillage monstre.
Épisode 2
Francis est de retour à la maison et compte bien fêter Halloween avec ses frères.
Épisode 3
Devant le manque évident d'intérêt que représente son anniversaire, Lois décide de quitter la maison.
Épisode 4
Pour faire plus ample connaissance, Abe et Kitty, les parents de Stevie, invitent Malcolm et sa famille au restaurant…
Épisode 5
La famille se rend dans un hôtel-casino pour un petit séjour de vacances.
Épisode 6
Hal et Lois passent la soirée à une convention de l’entreprise d’Hal, et confient les garçons vont rester à une baby-sitter…
Épisode 7
Lois se fait braquer au magasin par deux bandits, à quelques minutes de la fin de son service.
Épisode 8
Malcolm s'invente des troubles psychologiques pour échapper à une représentation sur scène.
Épisode 9
Malcolm se porte volontaire pour être figurant dans une pièce de théâtre. Devant son talent, le metteur en scène lui offre le premier rôle.
Épisode 10
Après s'être fait battre par une fille dans un match de lutte, Reese perd tous ses moyens et décide de devenir doux comme un agneau.
Épisode 11
Malcolm casse accidentellement le bras de sa voisine, une vieille dame particulièrement acariâtre
Épisode 12
Lois se demande pourquoi Malcolm ne met plus de slips. Mais le garçon est grand maintenant et son choix se porte sur les caleçons...
Épisode 13
Malcolm et sa famille fait connaissance avec ses nouveaux voisins lors d’un barbecue.
Épisode 14
Humilié devant la classe de Dewey, Hal décide de quitter son job afin d'assouvir sa passion : la peinture.
Épisode 15
Hal et Lois ont la (mauvaise) surprise de voir débarquer Ida et Victor, les parents de Lois.
Épisode 16
Lois est arrêtée par un policier pour une infraction routière qu'elle aurait commise.
Épisode 17
Malcolm est conduit à l'hôpital après des douleurs à l'estomac, où le médecin lui diagnostique une crise d'appendicite.
Épisode 18
Désespérés par ses résultats scolaires, Lois et Hal emmènent leur fils Reese suivre des cours de cuisine.
Épisode 19
Lois ordonne à Malcolm d'aider son grand frère, sans quoi Reese risquerait de se retrouver dans une section de remise à niveau.
Épisode 20
Malcolm et Reese doivent se rendre au bowling pour la soirée : Lois vs. Hal se proposent de les accompagner.
Épisode 21
Francis met ses deux frères Malcolm et Reese en concurrence pour savoir qui il va emmener avec lui voir un match de catch.
Épisode 22
Malcolm, Reese et Dewey découvrent une petite moto. Ensemble, ils passent tout leur temps libre à la réparer.
Épisode 23
Malcolm, Reese, Dewey et Stevie font le mur de chez eux pour se rendre à la fête foraine.
Épisode 24
Toutes les familles de la ville se retrouvent abrités au gymnase à la suite d'une fuite de gaz indirectement provoquée par Hal et Dewey...
Épisode 25
Pensant être enceinte, Lois fait un test de grossesse. L'occasion de se souvenir avec Hal de ses autres accouchements...